专利权转让和专利申请权转让二者既有相似之处，也有差别。相似之处是在于，两者权利的所有者通常情况下都是发明人(专利权有的时候也不一定就是发明人)，另外两者转让的客体是一项权利。

专利权转让与专利申请权转让的本质区别在于：

(一)、专利权转让中订立合同的标的是专利权，而专利申请权转让合同的标的是专利申请权;

(二)、专利权转让发生在专利授权之后，转让人为专利权人，而专利申请权转让则发生在专利授权之前，转让人为专利申请人。